Pod jedną z naw bazyliki kryje się podziemna kaplica. Na końcu schodów, które do niej prowadzą, jest brama, przez którą przez cały rok można tylko zaglądać do środka. Na początku listopada brama otwiera się dla pielgrzymów, a kaplica jest dostępna tylko dwa dni w roku.
Kaplicę zaprojektowano w XVII wieku, a w późniejszych latach kilka razy ją przebudowywano. Wnętrze jest niewielkie: stoi w nim mały ołtarz, a wokół mnóstwo mniejszych i większych szkatułek, pudełeczek i skrytek. W każdej z nich są relikwie świętych.
– Mamy tu ponad sto relikwii świętych. Chodzi zarówno o osoby, które żyły wiele lat temu, jak i te znane nam współcześnie. Są tu relikwie z całego świata – mówi RMF FM ojciec Marcin Ciechanowski, paulin z Jasnej Góry. Wśród nich są m.in. relikwie św. Walentego, męczennika z III wieku, oraz św. Marii Egipcjanki, a także św. Jana Pawła II, św. Maksymiliana Kolbego i św. siostry Faustyny.
Słowo „relikwie” pochodzi od łacińskiego reliquiae, czyli resztki, pozostałości. Mogą to być szczątki ciał, na przykład kości lub krew, ale też pozostałości przedmiotów, z którymi święte osoby się stykały. Naczynie, w którym przechowuje się je i eksponuje, to relikwiarz.
